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ABI熒光定量PCR操作步驟

ABI 熒光定量儀基于實時熒光定量 PCR(Polymerase Chain Reaction,聚合酶鏈式反應)技術。在 PCR 擴增過程中,隨著特定熒光染料與擴增產物結合,熒光信號強度會伴隨產物數量的增加而增強。儀器通過實時監測熒光信號,依據熒光信號達到設定閾值時的循環數(Ct 值),精準推算出初始模板的含量。為讀者全面呈現這一先進儀器的魅力。以下是ABI熒光定量PCR的一般操作步驟:

如何避免ABI pcr熒光定量儀出現溫度控制問題
  1. 準備工作:設計并合成引物和探針(若為探針法),準備好模板DNA、熒光定量PCR試劑、無菌水、離心管、移液器等實驗器材。
  • 開機與軟件啟動:先開電腦,再開儀器,最后打開軟件。
  • 實驗設置

– 雙擊桌面圖標,進入主界面后選擇“advanced setup”。

– 默認進入“setup”下的“experiment properties”界面,輸入實驗名稱,確認儀器型號,在實驗類型中,選擇“quantitation – comparative ct(△△ct)”等,選擇試劑種類(如探針法或染料法)。

  • 編輯基因及樣本

– 進入“setup”下的“plate setup”界面,在“define targets and samples”界面中設置基因及樣品。利用“add new target”添加新的基因,并在“target name”中編輯基因名稱,若是SYBR Green法,默認FAM通道即可;若是探針法,需在“reporter”和“quencher”中選擇所標記的熒光基團及淬滅基團。還可利用相關按鈕保存或刪除已添加的基因。利用“add new target”添加新的樣本,并編輯樣品名稱。

– 在“assign targets and samples”界面中進行樣品板的排布。利用鼠標單擊或拖拽以選擇反應孔,然后勾選左側的基因及樣本,同時在“task”選項中指定該反應孔類型(U代表未知樣本,N代表陰性對照,P代表陽性對照)。 – 在“select relative quantitation setting”中設置內參基因及對照樣本。

  • 設定反應條件及體積:進入“run method”界面,更改溫度及時間,確認所示圖標為點亮狀態,以保證信號正常采集。根據所使用的試劑和引物等優化反應條件,包括變性、退火、延伸的溫度和時間等。
  • 保存并運行實驗:點擊“save”,將文件儲存成“experiment document single files(*.eds)”格式,然后在“run”界面按下“start run”按鈕,反應即開始進行。
  • 結果分析

– 實驗結束后,點擊界面右上角的“analyze”按鈕,軟件將會顯示實驗結果。 – 在擴增圖中,可通過更改“plot settings”來改變擴增圖的顯示方式。如果想查看閾值線或基線,請將“threshold”及“baseline”打勾。

– 查看相對表達量結果時,利用“plot settings”選項,可以以不同方式顯示相對表達量的結果。

– 對于SYBR Green法實驗,可以在“melt curve”界面中查看熔解曲線,幫助確定產物類型,判斷是否有非特異性擴增。

– 檢測“qc summary”結果,可以快速查看實驗中是否有反應孔存在異常情況。黃色三角形中的數字代表異常情況的種數,詳細信息及解決方案可以在“flag details”中看到。

8. 數據導出與保存:分析之后的結果,可以利用菜單中的“file > export”功能,導出Excel格式的結果。若想存儲圖片結果,可直接在圖片上單擊鼠標右鍵,選擇“save as”,存成JPEG格式的圖片,也可以直接按相機圖標保存。

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